Ayant investigué, à l'époque, le mécanisme de la MethHb par intoxication au nitrite d'isopropyl j'étais, inévitablement, conduit vers l'énorme travail de Valérian Reithinger sur le sujet.

Tout comme la CarboxyHb par intox au CO, la SpO2 donnant des valeurs normales, les GS sont requis. Or, en l'attente d'un Cobas CB221 ou autre, un petit test de MacGyver reste possible. Une astuce ingénieuse livrée lors de sa présentation, qu'il me semblait intéressant de vous transmettre ici.

En s'appuyant sur la coloration typique du sang lors d'une MethHbémie (marron chocolat): "On peut, à l’hôpital au lit du malade, faire barboter de l’oxygène pur dans le sang; celui-ci garde sa couleur. Lorsqu’on ne dispose pas de source d’oxygène, on peut prélever 1 ml de sang dans une seringue de 10 ml. On remplit le reste de la seringue avec de l’air. On obture et on secoue énergiquement pendant une minute. Si le sang garde sa couleur chocolat, il existe une méthémoglobinémie" (vu que l'O2 ne peut pas se fixer à cause de l'oxydation du Fe2+ en Fe3+)

Génialissime !

Lors d’un précédent article votre humble serviteur porté à votre connaissance un futur danger qui, inévitablement, percutera notre société : l’antibiorésistance. Ce fléau gangrenant et rongeant progressivement, une à une, nos armes thérapeutiques, nous confrontera ainsi, en un avenir relativement proche, à l’emportement nûment d’un pan complet de notre espèce, Sapiens, par de courantes infections bactériennes.

A l’émergence de cet enjeux, une lutte s’est engagée, et de nouveaux stratèges ont vu le jour. L’outil dans lequel la recherche bactériologique s’est investit fut les bactériophages, des organismes capable de phagocyter (ingérer et dissoudre) ces bactéries résistances.

Nous concluions précédemment à l’hypothèse d’une possible phagoresistance de ces entités. Le phénomène ne serait pas nouveau.

La phagoresistance

De façon générale, cette résistance peut s’exprimer par différentes voies. Une première possibilité est d’empêcher les PNN ou les phagocytes de se diriger vers ces bactéries. Une autre est de tout opérer pour que les macrophages ne se collent pas à elles, en jouant de leurs configurations propres (capsules, pili, etc.). Ensuite, même si la fixation est effectuée, il reste possible à certaines bactéries d’échapper purement et simplement à l’ingestion, c’est le cas par exemple de N. gonorroeae. Enfin, un ultime champs d’actions pour ces bacilles ou coccis est de, une fois ingérés, résister à la phagocytose et croître au sein du phage.

Le cas du Pyo

Quiconque fut, quotidiennement, formé à l’identification bactérienne s’est déjà vu, au moins une fois, braver les interdits afin de sentir le parfum si particulièrement floral des colonies du Pyo (P. aeruginosa) sur GN. C’est précisément autour de ce bacille et ses particularités qu’une étude fut publiée dans la revue PLO Pathogens. Ses auteurs démontrèrent la capacité singulière du Pyo à, une fois phagocyté par un macrophage, lyser ce dernier. Ils exposèrent un des mécanismes principaux de cette cytotoxicité : l’interférence en l’expression du système de sécrétion de type 3 (T3SS) et son effecteur ExoS.

Homéostasie et environnement

De toutes ces esquives il faut en entrevoir leur raison: une nécessité à s’adapter. Tout élément vivant est mû, intrinsèquement, d’une profonde résilience, lui permettant de se soustraire aux contraintes extérieures qui le menacerait.

Dans un précédent article nous avions mis en avant que, contrairement à certains préjugés dualistes, les bactéries ont un rôle essentiel à notre organisme. Par exemple, le microbiote intestinal. Lieu grouillant de bactéries s’affairant à l’assimilation des nutriments (vitamines, AA, acide gras, etc.) essentiels au bon fonctionnement de notre corps. L’équilibre si précieux de cette populace s’opère par des voies et des processus si subtiles, si délicats, qu’il pourrait mettre factuellement en PLS le meilleur horloger Suisse. Un appui et une complicité mutuels, pourtant si contre-intuitive, de ces protistes anaérobies et aérobies, et leur encadrement par le système immunitaire, lui-même poussé par ce même écosystème microbien si nécessaire. Or, cette harmonie si malléable et résiliente reste fragile. Il a été démontré qu’en cas d’infection à T.gondii la production de Lc T CD4+ spécifiques, capable d’engendrer des IFN-y, avec des propriétés identiques aux Lc Th1 (sous-population des T), faisait naître une réponse immunitaire incapable de différencier les antigènes commensaux ou pathogènes, avec tous les dégâts que cela comporte.

Afin de mieux appréhender les différents processus de la phagoresistance une équipe du CNRS a démontré que l’environnement semble être un facteur clef. Étudiant les réactions d’E.coli face aux bactériophages in vivo (intestin) et in vitro (culture), ils ont pu révéler que certaines modulations de l’expression génétique des bactéries, permettant de feinter leurs régulateurs, étaient beaucoup moins marquées en culture qu’en milieu naturel. Laissant entrevoir, une fois de plus, la colossale capacité d’adaptation du monde bactérien.

Don’t look up

Aveuglée par son inconscience notre société, dites “hyper-évoluée”, n’a eu de cesse que d’éterniser, à l’infini, une fuite en avant sans but ni fin qui, plus que jamais, nous précipite à l’abîme. Dans ce colossal maelstrom, nous l’avons vu, l’antibioresistance tient et continuera de tenir sa place. Une adaptation bactérienne qui a échappé aux antibiotiques, aux phages et, sûrement, aux futures autres inhibiteurs que nous déploierons afin de contrer la lignée de conséquences que, successivement, notre civilisation a, elle-même, brillamment enfanté.

De ce collier d’anomies il faut en entrevoir sa raison profonde, la dénégation. Celle-là même qui nous pousse à fuir en des solutions d’encadrements bactériens toujours plus asphyxiantes, plutôt que de remettre en cause les racines de cette antibioresistance, notre exposition quotidienne aux antibiotiques (élevages intensifs, pesticide phytopharmaceutiques, adjuvants alimentaires, etc.), qui nécessiterait de totalement remodeler notre socle sociétaire. Afin d’éviter cette remise en question nous avons fait le choix de nous lover en une incurie court-termiste, mû par le profit et le maintient de cette aporie, qui sera inévitablement notre achévement. Ce déni inconscient est au cœur de notre société, fiché à tous les piliers porteurs de notre système, l’énergie, l’économie, l’environnement, la santé, etc. Don’t Look Up n’était pas une fiction, il est, en réalité, un de nos mythes fondateurs. Car, au fond de nous, nous le savons, tous ces démons, que nous avons rejeté à l’obscurité plutôt que les éclairer, seront les gardiens de nos limbes.

Si nous tentions d’entrevoir toute la grandeur du vivant, il serait optatif d’entamer un historique à sa singularité, où un espace euclidien, à t=0, enfanta de magiques et précieuses fluctuations quantiques jusqu’à son inébranlable mur de Planck, et créa des dimensions Lorentziennes qui se déployèrent à l’infini. De là, jaillit l’Atome Primordial et d’innombrables autres, qui s’étalèrent, s’organisèrent, s’ordonnèrent et s’agglomérèrent pour en former les astres, les galaxies, les constellations, les trous noirs et autres éléments qui constituent l’univers que nous connaissons. Au sein de cette gigantesque horloge cosmique, un minuscule grain de sable retiendra notre attention, notre brave et belle petite planète, Gaia, communément appelée Terre.

Ce globe qui vit, en sa surface, accueillir une multitude de formes vivantes par une perpétuelle et inépuisable évolution. Or, il y a près d’un milliard d’années de ça, un règne fut le pilier majeur à la modélisation de notre écosystème actuel, les mycètes.

Par leurs alliances et cohabitations, ils permirent au monde végétal et animal, le façonnant, de se déployer. Depuis, ils n’eurent de cesse de sous-tendre notre environnement.

C’est lors d’une habituelle conversation à l’Exode Urbain, autour du sujet de la résilience, que le propos me percuta. Il était question des cueillettes de champignons, plus précisément de la prospective qu’à l’avenir, au vu de la conjoncture, cette pratique se répandra et les coins se trouveront de plus en plus prisés, saturés et donc significativement raréfiés. Dès lors, la culture de champignons at home s’envisage comme alternative.

Pendant que les tasses de café se vidaient, en mon esprit, mon engagement à un tel projet s’étayer. Pour le lieu, la grande cave de mes parents sera idéale par son hygrométrie et ses vieux murs de soixante en pierre, que je squatterais pour l’occasion. Sur ces entrefaites, le savoir de cette discipline me manquait. Alors, j’ai commencé par dépoussiérer mes maigres cours de mycologie médicale avant d’amasser, compulsivement, livres, articles (par ex. ceux d’Andréas) et vidéos. Depuis aspiré par ce monde si vaste, insoupçonné et fascinant, je commençais à entrevoir leur importance et leur omniprésence dans notre quotidien. Par exemple, le pain, la bière, la lacto-fermentation sont issus de ces organismes. Certains mycéliums, doués de propriétés anti-bactériennes, ont noué des coopérations avec certains arbres, ces derniers apportant le nécessaire aux mycètes pour assurer leur déploiement, et les mycètes protégeant les racines de l’arbre des bactéries. Propriété que découvrit Fleming, nous livrant ainsi, la pénicilline et le spectre d’antibiotiques que nous connaissons aujourd’hui. Bref, leurs applications dans les champs alimentaire et médicinale sont majeures. Les carpophores (comestibles) apportes des nutriments intéressants, comme les vitamines B (B1, B2, B5, B8 et B9), PP, ainsi que du sélénium.

Partant de ces frêles connaissances d’autodidacte, je passais à la pratique avec la volonté de m’aventurer en cet infini domaine de façon progressive, par étape, afin de, selon, m’adapter au mieux, ainsi que gagner en compétences et connaissances.

En premier lieu j’optais, à la Mycosphére, pour un ballot de culture de Pleurotes (champignon le moins exigent et moins risqué), et assez rapidement ma premiére récolte apparu et fut importante (voir photos ci-dessous). Puis pour relancer la seconde pousse, j’ai laissé le substrat baigner dans l’eau toute une nuit, pour voir rapidement une seconde pousse émerger et effectuer une récolte quasi-identique à la première. Actuellement, la troisiéme (certainement ultime) pousse est en cours.

Ma prochaine étape sera de refaire un test avec un ballot de Shiitakes, et d’essayer de coloniser une buche de bois, par exemple avec des Pleurotes en huitre. Puis, avec le temps et le nombre d’essais suffisants, produire un S2 sur grain, espérant, ensuite, arriver à cultiver sur gélose (pratique que je maitrise par la discipline de la bacteriologie) pour repiquer du mycélium afin de coloniser un S1 sur grain, et ainsi gagner un peu plus en autonomie.

Vous l’aurez compris mon apprentissage en ce monde sans fin en est à ses prémices, toutefois la fascination à opérer une danse avec ces organismes si complexes sont tellement stimulantes. Moi qui, de nature, ai la main atomique, au vu des résultats optenus, je reste à pensé que le régne des mycètes m’ai adopté. Le Vivant est captivant, plus que jamais, j’y suis lové en ses filets.

La suite de mon apprentissage et de mes petits champi’ au prochain épisode…

Le bar de la Fontaine est une brasserie authentique du centre-ville, jouxtant une fontaine historique, d'où son nom. C'est en ce lieu que nous avions décidé de nous poser, Thierry CROUZET et moi-même, à l'occasion d'un de ses rares passages à Blois, pour une conférence, afin d'échanger quelques idées. Autour de notre petite table carré, le temps semblait suspendu. Notre jubilante conversation oscillait entre de douces utopies et quelques affres. Il était question de librisme, d'édition, de mon enthousiasme pour son oeuvre, de monnaie libre, de Nuit Debout, et d'autres sujets passionnants. Nous étions en avril 2016, et Thierry était plongé à l'écriture de Résistants. Au détour de quelques questions sur celui-ci, il ne fuita aucun détails de ce projet en gestation, mais me garantit l'importance de cette ouvrage. Aujourd'hui, Résistants compte parmis les écrits magistraux de ce brillant littérateur, de part sa forme romanesque où l'intrigue hyper-documentée laisse poindre le colossale travail de recherche sur le sujet, et par ce sujet capital traité: l'antibiorésistance.

Certains ont évoqué 2050, où ce fléau pourrait atteindre un climax de plus de dix millions de morts par an. Des milliers d'êtres humains annihilés par de courantes entérobactéries, comme E. coli, K. pneumoniae, ou par toutes autres bactéries communément traitables. Du remède, son mésusage, comme tout pharmakon, pourrait engendrer un séisme sanitaire catastrophique. Pourtant, penser, maladroitement, que le monde bactérien serait un mal qu'il faudrait éradiquer, cette croyance dualiste, occulterait une réalité: notre corps est constitué par bien plus de bactéries que de cellules, et que ces microbes contribuent au fonctionnement de notre organisme. Certaines sont essentielles à notre système digestif, d'autres jouent un rôle majeur au biofilm cutané, alors qu' une autre officierait à limiter les risques de diabète et maladies cardiovasculaires et certaines pourraient être porteuses de solutions au cancer. La pathogénicité bactérienne intervient à la suite d'une fracture dans l'équilibre de ce micro-écosystéme. Par différents leviers, cette virulence prend racine à travers des facteurs favorisant la colonisation, ou par leurs dommages directes (toxines bactériennes, ex: Clostridium tetani).

L'identification bactérienne fut, par ma formation professionnelle, une tâche quasi-quotidienne répétée sur quelques années, me permettant d'être témoin direct de cette antibiorésistance. A travers le MALDI-TOF ou, manuellement, sur une gélose Mueller-Hinton, voir les colonies gagner les disques imbibés de différents antibiotiques. Des antibiotiques ciblant des parties disparates de la bactérie, sa capsule, sa paroi, etc. Ce parcours, me donnant accès aux services d'analyse médicale les plus importants de la région, où, durant nos conversations, des biologistes et chefs de services en bactériologie me partageaient leurs angoisses de voir tomber, un à un, tel des dominos, les derniers remparts thérapeutiques à la résurgence bactérienne. Avant de me confier, qu'une des causes de cette émergente résistance prendrait pied, en grande partie, par l'utilisation massive d'antibiotiques par l'industrie de la viande. Cette information qui fit écho à ma lecture de Résistants quelques années auparavant, où Thierry Crouzet avait déjà exposé cette problématique. Hubris d'une société qui, par perte de son humanité, accoucha d'une énième ignominie en multipliant vertigineusement l'élevage intensif. Dès lors, engendré par ses conditions innommables, l'effroyable concentration nécessite, afin de maintenir en vie ses séquestrés, l'injection considérable d'antibiotiques. Antibiotiques qu'ingérera, en bout de chaine, le consommateur de viande, devenant, à plus ou moins long terme, antibioresistant et contribuant un peu plus à cette future bombe sanitaire.

Souvenons-nous que, mise à part la résistance naturelle, la glaçante ascension de l'émergence, naissant de l'évolution bactérienne par la présence répétée aux antibiotiques, de Bactéries Multi-Résistantes (BMR), puis Hautement Résistantes (BHR), et Ultra-Resistantes (BUR) et enfin, des Bactéries Toto-Resistantes (BTR) n'est que la réaction directe à nos successifs choix sociétaires d’inonder notre environnement d'antibiotiques. Poussant à nous armer de nouvelles thérapeutiques, comme l'utilisation de Bactériophages. Des virus capables de phagocyter certaines bactéries. Une fuite en avant, cherchant à rajouter une couche supplémentaire en traitant les conséquences et non les causes. Avant que les bactéries ne deviennent phagorésistante.

Devant un tel tableau, Fleming aurait pu être désolé du mésusage que notre société a faite de la panacée qu'il nous avait légué, de voir notre environnement imbibé d'un bain d'antibiotiques en tout genre: Comme pesticide sur nos plantes, comme biocide pour la désinfection des surfaces, comme boost pour maintenir une industrie de l'élevage intrinsèquement délirante, ou comme l'utilisation de pesticides (ex. Glyphosate) favorisant l'antibiorésistance. Fleming, serait le premier à nous alerter.

Pour aller plus loin:

• Rapport du ministére de la santé sur la préservation des antibiotiques
• Page du ministére de la santé -> Antibiorésistance: pourquoi est-ce si grave ?
• Antibio-Responsable: Site de Sanofi au sujet de l'antibiorésistance
• Résistants, livre de Thierry Crouzet sur le sujet
• Documentaire -> Abus d'antibiotiques : une catastrophe annoncée

Quel est le point commun entre Richard Stallman et Didier Pittet ? Si vous m'auriez posé la question il y a quelques mois de ça, j'aurais certainement répondu aucun. Pourtant, aujourd'hui ma réponse est différente.

Déjà, Stallman, je ne penses plus nécessaire de présenter ce mentor du libre. Ensuite, Didier Pittet est sûrement un nom qui nous est moins familier, et pourtant… Dans la lignée de Semmelweis (sujet de thèse doctorale de l'inégalable L.F Celine), Pittet a révolutionné le domaine sanitaire.

Alors que je commençais à travailler dans le champ paramédical, je découvrais l'utilisation du Sterilium® de la Solution Hydro-Alcoolique, son protocole, et l'importance que ce petit flacon me suive dans mes différents soins hospitaliers. Puis, quelques temps plus tard, j'ai vu la SHA se démocratiser au grand public, pour définitivement et pleinement s'ancrer à toute la population (hospitalier et civil) depuis la grippe H1N1.

J'en serais rester là, si je n'étais pas tomber sur l'excellent travail de Thierry Crouzet à ce sujet. Dans son ouvrage « le geste qui sauve », il transmet, entre autre, deux informations capitales : Derrière la SHA, que nous tous utilisons presque quotidiennement, se cache Pittet ; et que, cet inventeur à choisit de laisser en libre accès les formules et techniques de fabrication de la SHA.

A mes yeux, l’intérêt est double. Premièrement, démocratiser la fabrication et, en chuintant l'intermédiaire big-pharma, permettre aux pays défavorisés d'avoir accès à ce produit crucial. Deuxièmement, apporter à la problématique du désordre mondial généralisé, une solution locale et indépendante. Et, la production de la SHA démocratisé est un premier pas…